根据基础医学主干学科与特色学科布局，第一阶段主要建设肿瘤生物学、干细胞生物学与医学转化、免疫学、转化药学等特色方向。主要研究肿瘤发生发展的分子基础和作用机制，探索表观遗传调控、肿瘤干细胞与微环境、细胞代谢调控等在肿瘤发生发展中的作用。开展肿瘤精准医学，和分子诊断，为肿瘤的诊断与治疗提供分子靶标。建立干细胞分离、筛选、鉴定和培养等技术，解析干细胞增殖和分化的调控机理等科学问题，探索利用干细胞进行再生医学的转化应用，最终应用于人类疾病治疗、损伤修复及衰老延缓等。