2021年11月，我校动物医学院、医学研究院免疫学研究中心-焦寒伟实验室在《Cell Transplantation》杂志（影响因子IF：4.064），在线发表了题为“Identifying Circular RNAs in HepG2 Expressing Genotype IV Swine Hepatitis E Virus ORF3 Via Whole Genome Sequencing”的研究论文；2021年4月，在《Frontiers in Veterinary Science》杂志（影响因子IF：3.412，二区），在线发表题为“Deep Insight Into Long Non-coding RNA and mRNA Transcriptome Profiling in HepG2 Cells Expressing Genotype IV Swine Hepatitis E Virus ORF3”的研究论文。

猪戊型肝炎（Swine hepatitis E，SHE）是由猪戊型肝炎病毒（Swine Hepatitis E virus，SHEV）引起的以黄疸和急性病毒性肝炎为主要特征的人兽共患传染病。SHEV是一种单股正链的RNA病毒，其基因组长约7.2 kb，含有三个相互重叠的开放阅读框（Open reading frame，ORF），即ORF1、ORF2和ORF3。ORF3长度约为345 bp，是病毒的重要结构蛋白基因，能够编码多功能的小磷酸化蛋白。ORF3蛋白作为SHEV的重要毒力蛋白，广泛表达于宿主的细胞质、内质网和高尔基体。研究表明，ORF3蛋白可能参与调控病毒的特异性的免疫反应及细胞骨架的形成过程，还可能具有优化病毒在细胞中感染和复制的信号转导作用。

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图1：腺病毒介导SHEV ORF3 在肝癌细胞中成功过表达

图2：qRT-PCR检测SHEV ORF3基因的相对表达 

图3：Western Blot检验SHEV ORF3蛋白表达

图4：获得差异表达lncRNAs、circRNAs上调和下调频率

研究成果在全球范围内首次揭示出SHEV ORF3可能影响戊糖和葡萄糖醛酸的相互转换（Pentose and glucuronate interconversions，ko00040）lncRNAs (Cis-调控)的差异表达，而影响胆汁分泌（Bile secretion，ko04976）过程，继而介导梗阻性黄疸的形成；还首次筛选出调控肝癌细胞甘油三酯(triglyceride mobilization，GO:0006642)合成的6个关键内源性的hsa_circ_0002229、circRNA14701、hsa_circ_0093888、circRNA3581、circRNA3580和circRNA3582，以及参与核黄素代谢过程(riboflavin metabolism，ko00740)的4个关键内源性ciRNA410、hsa_circ_0130711、circRNA13511和hsa_circ_0130715，挖掘出SHEV ORF3可能通过上述的关键内源性circRNA-hosting gene而影响脂质代谢以及核黄素介导的脂质合成、转运和分解过程，这些发现为进一步阐释SHEV ORF3蛋白的功能和猪戊型肝炎病毒的致病机制提供了坚实的理论基础，还为防治新型人兽共患传染病-猪戊型肝炎提供了新思路。

图5：lncRNA-靶基因的功能分析

图6：差异circRNA-hosting gene功能分析

图7：揭示出参与甘油三酸酯和核黄素代谢的关键内源性circRNAs。

图8：SHEV ORF3蛋白影响肝癌细胞lncRNA cis-regualated调控胆汁酸分泌及甘油三酸酯和核黄素代谢过程的关键内源性circRNAs

焦寒伟实验室在猪戊型肝炎病毒领域的研究，目前已完成了赵宇、周志雄2名硕士研究生的联合培养，赵宇获得了唐立新奖学金、研究生国家奖学金、重庆市优秀毕业研究生；周志雄获得了研究生国家奖学金、重庆市精神文明建设先进个人。

西南大学动物医学院、医学研究院免疫学研究中心-焦寒伟为成果的第一作者兼通讯作者，该研究工作得到了国家自然科学基金(31802215)、重庆市基础研究与前沿技术研究计划(Cstc2018jcyjA0807)、重庆市自然科学基金(cstc2020jcyj-msxm0522)和中央高校基本科研业务费(XDJK2020C022, XDJK2019C024)的资助，同时该研究工作还得到了海南大学、贵州省农业科学院畜牧兽医研究所、重庆市荣昌区动物疫病预防控制中心和美国德克萨斯大学医学部的支持和帮助。

成果原文链接：https://doi.org/10.1177/09636897211055042

https://doi.org/10.3389/fvets.2021.625609